基因组测序中N50分析指的是什么？

基因组测序中N50分析指的是什么？

给你举个例子，比如一个基因组大小是1m，测序得到若干条reads，这些reads进行拼接，如果完山缓全可以拼接起来，中间没有gap的序列称为contig，即连续的意思。如果中间扒渣有gap,但是可以知道gap的长度，这样的序列就叫做scaffold,即脚手架（非连续）的意思。然后把contig和scaffold从长到短进行排列，然后相加，当恰好加到1m的50％，也就是500k的时候，那一条contig或者春唯悄scaffold的长度就叫做contign50和scaffoldn50。很明显这个数值越大说明组装的质量越好。